Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf3Q5HZG4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Taf3Q5HZG4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms