Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf354cQ571J5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms