Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Smim26Q3V460 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Smim26Q3V460 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Smim26Q3V460 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Smim26Q3V460 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms