Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1d1Q3UV55 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms