Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pitpnm3Q3UHE1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitpnm3Q3UHE1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms