Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE31

Uncharacterized protein KIAA0930 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UE31 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UE31 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UE31 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UE31 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UE31 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms