Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt2Q3TTY5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms