Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms