Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd11Q1RNF8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms