Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisal1Q0VBP7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shisal1Q0VBP7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms