Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms