Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NeblQ0II04 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms