Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnnm1Q0GA42 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms