Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms