Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MestQ07646 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MestQ07646 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MestQ07646 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MestQ07646 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms