Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms