Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms