Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sox12Q04890 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms