Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1Q04750 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms