Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Crisp3Q03402 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms