Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx2Q00262 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms