Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
rp9P97762 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
rp9P97762 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
rp9P97762 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
rp9P97762 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
rp9P97762 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
rp9P97762 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
rp9P97762 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
rp9P97762 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms