Protein–RNA interactions for Protein: P97326

Cdh6, Cadherin-6, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh6P97326 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdh6P97326 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdh6P97326 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms