Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprn2P80560 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms