Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldb1P70662 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldb1P70662 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms