Protein–RNA interactions for Protein: P63137

Gabrb2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb2P63137 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb2P63137 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms