Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ppfia3P60469 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms