Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TspoP50637 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TspoP50637 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TspoP50637 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms