Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PtpreP49446 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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