Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbp3P49194 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms