Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gli1P47806 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gli1P47806 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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