Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PtgfrP43117 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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