Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp4P35123 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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