Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifnar1P33896 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifnar1P33896 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms