Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PIBF1-207ENST00000615625 1098 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PSMC1P11-201ENST00000405257 1317 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 SNHG26-202ENST00000422542 1106 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 GNAS-209ENST00000371081 730 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 OR7E26P-201ENST00000502808 1006 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC091563.1-201ENST00000520544 490 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 OR7E2P-201ENST00000533071 889 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 LINC01579-206ENST00000556928 657 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.125-201ENST00000618659 283 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AL627171.2-201ENST00000635177 1090 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms