Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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