Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BrafP28028 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BrafP28028 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BrafP28028 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BrafP28028 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BrafP28028 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BrafP28028 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BrafP28028 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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