Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmo2P25801 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmo2P25801 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms