Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms