Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01878 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01878 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01878 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01878 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01878 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01878 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01878 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01878 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01878 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01878 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01878 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01878 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01878 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01878 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01878 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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