Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01641 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01641 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01641 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms