Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms