Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnal1O88327 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnal1O88327 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms