Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms