Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ptpn20O55082 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptpn20O55082 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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