Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm44O35857 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Timm44O35857 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm44O35857 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms