Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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