Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms