Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms