Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms